谷歌的 AlphaGenome 2 聚焦于疾病的细胞起源

谷歌 DeepMind 的研究人员推出了一种新的人工智能模型,旨在揭示 DNA 的变化如何影响不同的细胞。

AlphaGenome 2 是 DeepMind 基因组预测 AI 模型 AlphaGenome 的继任者。 去年推出。虽然人体中几乎每个细胞都携带相同的 DNA,但不同的细胞类型,从心肌细胞到皮肤细胞再到抗感染免疫细胞,会打开和关闭不同的基因,并且这些模式可能会根据细胞的行为而改变。因此,根据细胞的类型和状况,相同的遗传变异可能会产生截然不同的效果。

新模型旨在通过预测遗传变异对个体细胞类型和状态的影响来捕捉这些差异。谷歌说: 博客文章 周三发布的这份报告表示,它提供了比 AlphaGenome 等更广泛的模型更详细的视图,有可能揭示特定细胞中与疾病相关的影响,否则这些影响可能会被忽视。

AlphaGenome 2 接受了 68 个组织中超过 1 亿个个体细胞图谱的训练,以提供更详细的视图。 DeepMind 表示,该模型可以有效地转换静态细胞图谱。 庞大的地图和目录数据池 单个细胞的详细信息——“被转化为人类遗传学的预测引擎。”据该公司称,AlphaGenome 2 识别出的变异数量几乎是之前尖端模型的两倍,这些变异可以改变细胞中的基因表达。

具体来说,研究人员发现 AlphaGenome 2 能够预测新的细胞类型和生物状态,而无需重新训练。它还可以识别实验数据中的差距,帮助科学家决定下一步在实验室中研究什么。

参与该项目的谷歌 DeepMind 研究科学家 Adam Gayoso 表示,最大的突破是“将人类遗传学与细胞生物学联系起来”。他说,AlphaGenome 2 使研究人员能够深入研究在大量人群中发现的遗传变异,了解它们在细胞水平上可能产生的影响,并可能将这些影响与疾病联系起来。 临界点。

谷歌 DeepMind 基因组学负责人 Žiga Avsec 表示: 临界点 请注意,如果您有一个目标,例如找出如何治疗特定疾病,那么这种特异性就很重要。他解释说:“当你开发药物时,你会针对特定的蛋白质和特定的细胞类型,”这使得这种细节水平至关重要。

Avsec 表示,由于新技术能够以高分辨率捕获单个细胞及其状态并创建训练它所需的大型数据集,因此构建像 AlphaGenome 2 这样的模型直到最近才成为可能。 DeepMind 现在正试图通过生成更多数据来改进其遗传模型,其中包括目前尚未得到很好体现的细胞状态。 Avsec 表示,未来的版本可能会“根据多个物种的数据进行训练”,从而为模型提供更广阔的生物学视野。他说,从长远来看,像 AlphaGenome 2 这样的模型可以有助于创造:虚拟细胞旨在模仿生物系统的数字模拟。

虽然 Avsec 表示将 AlphaGenome 2 视为 AlphaGenome 的继任者,但它不会很快取代它。他说,更详细的预测会增加计算成本,并且比以前的预测“更昂贵”。这些要求使得使用 AlphaGenome 2 生成覆盖“人类基因组中所有可能的 DNA 字母变异”的全基因组图谱变得不切实际,DeepMind 在 9 月份发布了该图谱。

谷歌表示,从今天开始,它将通过 AlphaGenome API 将 AlphaGenome 2 用于非商业研究,并为商业研究提供有限的“私人预览”。

该模型是谷歌和竞争对手人工智能实验室不断努力利用技术解决科学和医学重大问题的最新成果。 Pushmeet Kohli,DeepMind 人工智能科学研究负责人 隐含的 他表示,更多令人印象深刻的科学成果即将取得,预计该组织很快将在英国开设一个自动化材料科学实验室。与此同时,Anthropic 正在试验药物设计,并为 Claude 提供了一个湿实验室,而 OpenAI 正在解决数学和相关领域中大量长期存在的问题。

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